On a comme exemple d'endoribonucléases des protéines simples comme la RNase III, RNase A, Ribonucléase T1 et RNase H, mais aussi des protéines complexes comme la RNase P et le complexe RISC. 可以是单个蛋白,如RNase III、RNase A、RNase T1和RNase H,也可以是单个或多个蛋白与RNA的复合体,如核酶RNase P和RNA诱导沉默复合体(RNA-induced silencing complex,RISC)。